為了規(guī)范進(jìn)出口貨物減免稅管理，保障進(jìn)出口貨物減免稅申請人(以下簡稱減免稅申請人)的合法權(quán)益，海關(guān)總署根據(jù)有關(guān)法律和行政法規(guī)的規(guī)定，制定了減免稅管理辦法。
(一)減免稅申辦手續(xù)
減免稅申請人除特殊情況外應(yīng)當(dāng)向其所在地主管海關(guān)(以下簡稱主管海關(guān))申請辦理減免稅備案、減免稅審批、減免稅稅款擔(dān)保和后續(xù)管理業(yè)務(wù)等相關(guān)手續(xù)，向進(jìn)口口岸海關(guān)(以下簡稱口岸海關(guān))辦理減免稅貨物進(jìn)出口通關(guān)手續(xù)。
減免稅申請人可以自行也可以委托他人向海關(guān)申請辦理上述手續(xù)。委托他人辦理的，應(yīng)當(dāng)由被委托人持減免稅申請人出具的“減免稅手續(xù)辦理委托書”及其他相關(guān)材料向海關(guān)申請，海關(guān)審核同意后可準(zhǔn)予被委托人辦理相關(guān)手續(xù)。
投資項目所在地海關(guān)與減免稅申請人所在地海關(guān)不是同一海關(guān)的，減免稅申請人應(yīng)當(dāng)向投資項目所在地海關(guān)申請辦理減免稅備案、審批手續(xù)。
投資項目所在地涉及多個海關(guān)的，減免稅申請人可以向其所在地海關(guān)或者有關(guān)海關(guān)的共同上級海關(guān)申請辦理減免稅備案、審批手續(xù)。有關(guān)海關(guān)的共同上級海關(guān)可以指定相關(guān)海關(guān)辦理減免稅備案、審批手續(xù)。
投資項目由投資項目單位所屬非法人分支機構(gòu)具體實施的，在獲得投資項目單位的授權(quán)并經(jīng)投資項目所在地海關(guān)審核同意后，該非法人分支機構(gòu)可以向投資項目所在地海關(guān)申請辦理減免稅備案、審批手續(xù)。
減免稅貨物申辦的流程是：辦理減免稅備案手續(xù)一辦理減免稅審批手續(xù)一實際進(jìn)出口減免稅貨物。
1．減免稅備案手續(xù)
減免稅申請人按照有關(guān)進(jìn)出口稅收優(yōu)惠政策的規(guī)定申請減免稅進(jìn)出口貨物前，應(yīng)持下列單證向主管海關(guān)申請辦理減免稅備案手續(xù)：
(1)進(jìn)出口貨物減免稅備案申請表；
(2)企業(yè)營業(yè)執(zhí)照或者事業(yè)單位法人證書、國家機關(guān)設(shè)立文件、社團(tuán)登記證書、民辦非企業(yè)單位登記證書、基金會登記證書等證明材料；
(3)相關(guān)政策規(guī)定的享受進(jìn)出口稅收優(yōu)惠政策資格的證明材料；
(4)海關(guān)認(rèn)為需要提供的其他材料。
上述單證應(yīng)當(dāng)交驗原件，同時提交加蓋減免稅申請人有效印章的復(fù)印件。
2．減免稅審批手續(xù)
減免稅申請人應(yīng)當(dāng)在貨物申報進(jìn)出口前，持下列單證向主管海關(guān)申請辦理進(jìn)出口貨物減免稅審批手續(xù)：
(1)進(jìn)出口貨物征免稅申請表；
(2)企業(yè)營業(yè)執(zhí)照或者事業(yè)單位法人證書、國家機關(guān)設(shè)立文件、社團(tuán)登記證書、民辦非企業(yè)單位登記證書、基金會登記證書等證明材料；
(3)進(jìn)出口合同、發(fā)票，以及相關(guān)貨物的產(chǎn)品情況資料；
(4)相關(guān)政策規(guī)定的享受進(jìn)出口稅收優(yōu)惠政策資格的證明材料；
(5)海關(guān)認(rèn)為需要提供的其他材料。
止述單證應(yīng)當(dāng)交驗原件，同時提交加蓋減免稅申請人有效印章的復(fù)印件。
海關(guān)審核同意后向減免稅申請人簽發(fā)“中華人民共和國海關(guān)進(jìn)出口貨物征免稅證明”(以下簡稱征免稅證明)。
除國家政策調(diào)整等原因并經(jīng)海關(guān)總署批準(zhǔn)外，貨物征稅放行后，減免稅申請人申請補辦減免稅審批手續(xù)的，海關(guān)不予受理。
3．實際進(jìn)出口貨物
減免稅申請人持海關(guān)簽發(fā)的征免稅證明，并在有效期內(nèi)向口岸海關(guān)辦理進(jìn)出口貨物通關(guān)手續(xù)。若不能在有效期內(nèi)辦理，需要延期的，應(yīng)當(dāng)在征免稅證明有效期內(nèi)向主管海關(guān)提出延期申請。經(jīng)主管海關(guān)審核同意，準(zhǔn)予辦理延長征免稅證明有效期手續(xù)。
4．稅款擔(dān)保
若出現(xiàn)以下情形的減免稅申請人可以在貨物申報進(jìn)出口前持有關(guān)單證向主管海關(guān)申請憑稅款擔(dān)保先予辦理貨物放行手續(xù)：
(1)主管海關(guān)按照規(guī)定已經(jīng)受理減免稅備案或者審批申請，尚未辦理完畢的；
(2)有關(guān)進(jìn)出口稅收優(yōu)惠政策已經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，具體實施措施尚未明確，海關(guān)總署已確認(rèn)減免稅申請人屬于享受該政策范圍的；
(3)其他經(jīng)海關(guān)總署核準(zhǔn)的情況。
減免稅申請人持準(zhǔn)予擔(dān)保的證明向口岸海關(guān)辦理減免稅貨物稅款擔(dān)保手續(xù)。